In de eerste twee games werden vijf chapiters behandeld. De originele Dreamcast ging dieper in op het eerste hoofdstuk, waarna een manga het tweede hoofdstuk uitklaarde. Shenmue 2 was groter en deed de gebeurtenissen uit hoofdstuk 3 tot 5 uit de doeken, dus Shenmue 3 begint bij het zesde. Suzuki zelf wil het volledige verhaal in vier à vijf games vertellen en aan de geweldige interesse voor de Kickstarter-campagne te zien, kan dat best lukken.
